大家都知道，蘑菇集中生产对环境的要求很苛刻。因为，从菌袋髙压灭菌后出炉始，经预冷、强制冷却至接种完成，而后将菌袋移放到发菌室止，应该是无菌的全封闭洁净空间，窗明墙净、生产用具一尘不染，并有良好的通风换气设施。在建造或改造生产用房时，任何将髙压灭菌与冷却分离或将冷却与接种室分离都是不可取的、有害的。因为，空气中的杂菌一部分游浮于空间,相当一部分附着于空气中的尘埃,所以在正常情况下应尽力想方设法减少生产用房和周围环境空气中的细菌总数。
灭菌是指在一定范围内用物理或化学的方法，彻底杀灭物料、容器、用具和空气中的一切微生物，包括微生物的营养体和休眠体，使物料成为无菌状态。消毒是采用物理或化学的方法，杀灭或清除基质中、物体表面及环境中的部分微生物。除菌是一种机械方法(如过滤、离心分离、NICOLER动态杀菌技术等)，除去液体或气体中微生物的方法。防腐是用来防止或抑制微生物生长繁殖的技术，是一个抑菌过程。杀菌泛指杀死微生物菌体，通常不包括芽孢，有这种作用的药剂称为杀菌剂。
消毒灭菌是排除杂菌干扰，为蘑菇创造洁净生长环境的重要保证，也是蘑菇生产中的一项基本技术，是蘑菇生产成败的关键环节，其分别为：
1、紫外线消毒法，其杀菌机理是当其作用于生物体时，可导致细胞内核酸和酶发生光化学反应，而使细胞死亡。
2、使用臭氧发生器，能高效、快速杀灭空气中和物体表面各种微生物，接种成功率可达97％以上；同时具有性能稳定、操作简单、耗电小的特点。不要在有人的情况下工作。
在蘑菇的加工中使用臭氧。从而有效提高蘑菇的卫生安全质量。
