常用药物副作用多，如胃肠反应、药疹、皮肤过敏等，这些副作用较为明显，且为一般人所知晓。为人们注意不多的是，药物还有一种广泛的副作用———人体自然免疫机能损害。随着医学研究的深入，科学家越来越认识到：人体自身存在着强大的自然防病机制，但在临床上，医生常是大量使用化学类药物去替代它，其严重后果是，人体自身的防病机制日益运转不灵。
生理学研究认为，人体能够自己抵御疾病的机制，是人类在千百万年的进化中形成的。临床多见的发烧症状，就是人体与病原体之间斗争的明显标志，许多症状表明，受感染体温升高是人体自我保护机能所作出的反应，许多动物也有这种表现。发烧作为保护机理在动物中存在千百万年。发烧病人服用退烧药后，抵抗力会明显减弱，传染期也比没有服药的人长。退烧药主要通过控制人的发热中枢退烧，但同时也降低了人体白细胞反应，废置了人本身的“保护作用”，反而延长生病的时间。
事实上，不仅退烧药，用于治疗其它病症的药物大都也如此。例如止痛药剂量越用越大，是因为人体的抗痛机能因药物干扰而逐渐变得迟钝；抗哮喘药虽使哮喘症状暂时缓解，但病理变化反而加重，并将酝酿着越来越重的复发；用碱性药物治疗胃酸过多症和胃溃疡病，不仅不能使病灶愈合，反而会导致胃酸越发增多，形成把小苏打当饭吃的局面；长期使用抗凝血药，则使人体和凝血机制减弱，一旦停药，往往会出现可怕的血栓；泻药用久了，肠功能会部分瘫痪，便秘情况比使用泻药之前更糟。
人体自身抗病机制十分复杂，至目前并未被人们所充分认识，因此，药物对人体抗病机制的损害很难被人们充分估计到。国外科学最近研究发现，临床常见的缺铁性贫血症，致因复杂。细菌和其他病原体需要铁才能生长，患有某些感染性疾病后，人体会让铁成为缺乏性物质，以利于机体抗病。一系列研究证明，这样的缺铁性贫血会产生的正面影响。但在临床上，医生往往给病人大量补铁，补铁后病情况反而更加严重。许多结核病患者常有这种情况。鉴于化学类药物对人体副作用多，科学家们对临床大量用药十分担心，专家们提出，患有慢性病或免疫功能低下疾病的患者，应尽可能地采用饮食、体育、音乐等自然疗法，或是选用具有调节免疫系统功能的中药、针灸疗法，非在不得已时，再用药物以助人体“一臂之力”。
