无菌室一般是在微生物实验室内专辟一个小房间，实验室对洁净卫生环境就有特殊要求；无菌室对工作人员有严格要求，为了防止微生物污染，要求消毒杀菌，然而鞋底清洁机就能很好地辅助无菌室进行清洁与消毒。
无菌室对工作人员要求在进入无菌室前，必须用肥皂或消毒液洗手消毒，然后在缓冲间更换工作服，鞋，帽子，口罩和手套，方可进入无菌室进行操作。无菌室使用前必须打开无菌室的紫外灯辐照灭菌30分钟以上，并且同时打开鞋底清洁机进行吹风。操作完毕，应及时清理无菌室，再用紫外灯辐照灭菌20分钟。
在无菌室操作难免会将菌液洒在桌上或地上，在操作时工作的衣帽等受到菌液污染，无尘鞋也会受到污染，为了不让污染物带出无菌室；这时候企净鞋底清洁机就能发挥它的作用了，该设备具备了清洁消毒于一体的新型清洁设备；能够将鞋底污染物及细菌跟彻底抹杀，彻底隔绝在无菌室外。
当前无菌室多存在于微生物工厂，一般实验室则使用鞋底清洁机。鞋底清洁机其主要功能是利用履带式毛刷结构配合循环水清洗模式利用电动机驱动环形毛刷，带净水清洗鞋底面上部包括微生物在内的各种微小尘埃。连环制毛工艺，是鞋底清洁干净；确保鞋底污染物和细菌不通过鞋底带入到无菌室，以免影响无菌室内的“平衡状态”。
无菌操作技术当前不仅在微生物学研究和应用上起着举足轻重的作用，而且在许多生物技术中也被广泛应用。例如转基因技术、单克隆抗体技术等；因此要加请对无菌室的洁净环境的控制，无菌室一般是在微生物实验室内专辟一个小房间，可以在进入无菌室的入口安装鞋底清洁机保证将鞋底上的污染物及细菌与无菌室彻底隔绝。
