目前，从水体消毒的种类来说，有氯气、次氯酸钠、漂白粉、三氯异氰尿酸(二氯异氰尿酸钠)、二氧化氯、双氧水、臭氧等药剂和方式，此外还有紫外线消毒等一些手段。
由于氯气在运输、存储方面存在安全隐患；在定量投加方面，因氯气在水中的溶解度较低，氯气容易散失，使得水中留存余量难以达到标准；同时，氯气瓶气压不断变化，存在投加计量不够准确的问题；氯气具有极强的扩散性，对环境存在毒害作用；游离氯的高活性容易形成许多象四氯化碳一类的致癌物质，故而，在常规消毒领域，取消液氯的主张越来越多，也日益受到人们的关注。
就拿氯气的安全性来说，就始终是一个让人时时警觉的问题。在我国，几乎每年都有氯气罐泄漏的安全事故发生。氯气作为危险品受到各国安全机关的严格管制。前些年，发生在福建三明火车站氯气瓶运输中的跑氯事件，造成几千人的紧急疏散；在北京有些游泳场由于操作人员不谨慎，三分钟的跑氯，就有37名孩子住进医院。2005年3月29日18时50分，江苏省淮安市境内，一辆山东鲁H－00099装有液氯危险品的运输车，行至京沪高速公路上行线103KM＋300M处，与一辆鲁QA0938货车相撞，导致鲁H－00099侧翻液氯泄漏。截止3月31日8时，此事故已造成28人中毒死亡，285人被送往医院救治。事故发生后，有关部门立即组织疏散村民群众近1万人，造成京沪高速公路宿迁至宝应段关闭20个小时。我国的天津地区就明确规定公共娱乐场所禁用氯气进行消毒。
在国外许多发达国家，如美国、德国、日本等对氯气的使用有严格的限制，氯气主要用于污水处理。而公用场所和中小型自来水厂一般不再使用液氯，而多使用次氯酸钠液体进行消毒。当然，也可根据用水量的情况，采用其它消毒方法。如小量饮用水的消毒就可以采用诸如紫外线、臭氧、双氧水等手段进行灭菌杀毒。
氯气、次氯酸钠、二氧化氯和臭氧[1]都是工农业生产和日常生活中比较容易见到的几种强氧化剂，除臭氧以外，它们均为非天然存在的化学物质。一般都可以用作水体杀生剂。它们不仅具有灭杀细菌和病毒的功能，还能够漂白纸张、纤维以及用作化学合成等。广泛用于自来水消毒、游泳池水消毒、污水处理、循环水除藻、造纸工业、化学合成业、以及医药卫生和防疫等各个领域。
但是，不同的药剂具有不同的性能和特点，就如同不同厂家的产品具有并不相同的质量一样。氯气、次氯酸钠、二氧化氯和臭氧在物理化学性能上，以及实际使用中都有很大的区别。就这几种消毒剂的应用来讲，次氯酸钠最为安全有效，易于储存，使用最为方便。
二氧化氯用作水消毒通过近些年的推广使用，确有许多不尽人意的地方，实际运用效果和实验室结果差别很大，药物投加不能使水质达到规定指标，安全性也很差。这些缺陷是与二氧化氯的性质和运用技术有密切关系的，也与需求单位现有设备管理人员的知识水平有关。目前，国家也没有针对二氧化氯制定一个比较完善统一的产品国家标准，也不能确定一套最为成熟可行的有效解决方案。尽管在全国召开了几次有关二氧化氯的会议，但是，二氧化氯所表现出的不够稳定之特性，表明对于二氧化氯参与漂白和消毒的机理还有待深入研究，二氧化氯在消毒领域和臭氧一样仍然处于探索和产品改进阶段。
次氯酸钠仍然是比较稳定可靠的杀生剂。次氯酸钠发生器经过许多年的发展和改进，建立了严密的国家标准，已经成为一种相当完善的实用性设备，值得大范围推广。
